Après ses études, il travaille principalement en tant qu'animateur indépendant sur diverses productions de dessins animés pour Pen Film à Gand. Les plus connus d'entre eux sont ‘Jonas en de Wonderwinkel’ et aussi ‘Jean sans peur’ 1984. Il contribue également à l'animation de Sesame Street et Het Liegebeest. En 1987, Verhaegen commence à travailler sur la série de bande dessinée Boes pour les éditions Standaard. En 1988, il écrit une bande dessinée de quatre pages, entièrement dans le style de la série bleue, pour la réédition du classique Le Trésor de Beersel de Bob et Bobette pour la KBC. Cela attire l'attention de Paul Geerts et Willy Vandersteen, qui ont grandement apprécié le travail. Il lui est ensuite demandé de collaborer à la série Bob et Bobette. Il écrit d'abord un certain nombre d'histoires courtes, puis en 1992 sa première longue histoire, La Carcasse de Carcassonne. Fin 1999, Verhaegen prend la suite de Paul Geerts en tant que dessinateur / scénariste permanent de Bob et Bobette. Au total, Verhaegen écrit et dessine 32 longues histoires de Bob et Bobette et contribue à 65 histoires. Il dessine également et écrit treize courts récits et réalise de nombreux dessins publicitaires de Bob et Bobette.En 2005, Verhaegen commence la série Senne et Sanne. Son premier roman graphique, ‘Het Beest is los’, a été publié en 2022.